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真菌18S rDNA/ITS菌种鉴定
   传统的真菌分类鉴定主要依据是形态、生长及生理生化变化特征等特征。然而由于真菌种类繁,其生长形态、生理生化变化等随环境的变化也不稳定。因此,采用传统方法鉴定有其局限性。随分子生物技术发展,DNA序列已经广泛测序。通过对真菌保守变异序列测序,可进行菌种鉴定。目前常用的有18S rDNA和ITS。通过PCR扩增,测序,与GenBank中的已知序列进行比对后,判定真菌种类,将真菌划分到属或种。 
  竟博JBO提供扩增真菌18S rRNA序列,约1,700 bp,或ITS,大概在300-700bp,进行扩增,测序,BLAST,对样品进行鉴定。真菌的ITS (Internal Transcribed Space) 基因,包括ITS1及ITS2两部分,进化速度快,具有多态性,适于对亲缘关系较近的菌株进行区分鉴定。
服务要求
  1.样品形式可以是新鲜菌液、斜面培养基、平面培养基或者提取好的DNA。
  2.如果样品为基因组DNA,DNA浓度>10ng/ul,体积大于20ul。
  3.鉴定结果一般可以鉴定到种。个别菌种由于微生物数据库相关数据缺乏,只能鉴定到属。如遇这种情况,正常收费。
  4.如果测序结果出现如下套峰,视为样品不纯,本公司将收取全额实验费用。并建议克隆多个测序鉴定。
  5.对于某些致病性菌体,请提前说明,注意?;すぷ魅嗽苯】导盎肪澄郎?。
服务基本流程
  1.竟博JBO进行引物设计合成;
  2. PCR扩增18S rDNA/ITS;
  3. PCR产物纯化;
  4. 测序,序列比对分析。
服务报告内容
  实验报告包括PCR产物照片、NCBI序列比对鉴定结果、测序报告、序列碱基图;
  注:对于鉴定的菌株,我们不做备份及保留,请送检之前做好保种工作。
服务编号
服务项目
内容说明
价格
周期
SGSBD11
真菌18S rDNA菌种鉴定
18S rDNA序列扩增,PCR产物测序,比对分析
¥500/样品
1-2周*
SGSBD12
真菌18S rDNA菌种鉴定
18S rDNA序列扩增,克隆测序,比对分析
¥1000/样品
1-2周*
SGSBD13
真菌18S rDNA文库构建及真菌群落多样性分析
18S rDNA文库构建,RFLP等
询价
5-6周*
SGSBD14
真菌ITS菌种鉴定
真菌ITS1,ITS4,ITS5全ITS序列扩增,PCR测序鉴定
¥500/样品
1-2周*
SGSBD15
真菌ITS菌种鉴定
真菌ITS1,ITS4,ITS5全ITS序列扩增,连接T载体测序鉴定
¥1000/样品
1-2周*

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细菌16S rDNA菌种鉴定

菌种鉴定常见问题解答


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