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微生物多样性分析(DGGE技术)
  DGGE是根据DNA在不同浓度的变性剂中解链行为的不同而导致电泳迁移率发生变化,从而将片段大小相同而碱基组成不同的DNA片段分开。具体而言,就是将特定的双链DNA片段在含有从低到高的线性变性剂梯度的聚丙烯酰胺凝胶中电泳,随着电泳的进行,DNA片段向高浓度变性剂方向迁移,当它到达其变性要求的最低浓度变性剂处,双链DNA形成部分解链状态,这就导致其迁移速率变慢,由于这种变性具有序列特异性,因此DGGE能将同样大小的DNA片段很理想地分开,它是一种很有用分子标记方法。现已广泛应用于生物多样性调查、亲缘关系鉴定、基因突变检测等多个领域。

竟博 www.zgsyou.com   竟博JBO目前已经进行的样本类型:土壤样本(森林,农田,池塘淤泥等);肠道样本(鸡,鸭,鱼,鼠等);粪便样本(昆虫,鼠,鸡,鱼,鸭,婴儿等);污水处理材料(生物膜,高分子材料);食品(如腊肉,火腿,鸡肉,茶叶等)沼池,不同处理前后水样,空气,酒曲等。
  竟博JBO目前已经进行的菌群类型:常用细菌,真菌,古菌,产甲烷菌,产甲烷氧化菌,固氮菌,硝化细菌,反硝化细菌,氨氧化古菌等。

服务要求
  1)环境样本或环境DNA 样本。
  2)细环境样品及其中的细菌是否具有致病性和潜在危险,如您对样品具有一定的致病性或均有潜在的危险,请您提供样本DNA。
  3)数据分析:和客户详细沟通,确认分析方案:胶图分析(样本间或组间的聚类分析,PCA分析,灰度值分析,多样性指数分析
);序列分析(序列比对分析,结合图谱分析样本里边的优势种群分布情况,并进行系统发育树分析)。
服务流程
  1)前期确认阶段:试验样本类型,数量,引物,签订试验合作合同;
  2)试验阶段:DNA提取,PCR扩增,变性梯度凝胶电泳,确认回收克隆条带;目的片段的克隆测序;(30个工作日)
  3)请您提供新鲜的且足量的材料,或直接提供纯化好的总RNA或DNA(大于5ug/样品)。
  4)提供已知的全长基因序列, GeneBank ID,详细背景资料,DNA/RNA来源、丰度等。
报告内容
  胶图分析(样本间或组间的聚类分析,PCA分析,灰度值分析,多样性指数分析);序列分析(序列比对分析,结合图谱分析样本里边的优势种群分布情况,并进行系统发育树分析);

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